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实验室级

 

 

咨询服务:

负染、冷冻制样准备与流程、铜网选择、铜网表面处理、电镜基本操作、电镜手动收数据流程、电镜自动收数据流程、Linux系统使用、电镜数据处理软件使用、电镜电子密度图操作软件使用、电镜电子密度图模型搭建软件使用。

 

工作站或服务器运维服务:

系统安装及维护、单颗粒应用软件的安装与维护、单颗粒应用软件的更新。

 

定制服务:

其他软件安装及调试、特定脚本编写/修改服务。

 

 

平台级

 

电镜平台服务:

200kV/300kV冷冻电镜自动收数据软件安装与调试、200kV/300kV冷冻电镜自动收数据软件脚本、数据自动传输软件、数据自动预处理软件、200kV/300kV冷冻电镜配置电脑网络安装与调试、200kV/300kV冷冻电镜自动收数据软件SerialEM及自由产品更新运维。

 

集群管理与运维:

实地(辅助)上架部署方案,安装硬件、集群管理软件安装与部署、分布式存储软件安装与部署、测试电镜收数据端与集群存储之间的网络速率、调整电镜收数据端与集群存储之间的网络传输方案,保证各种格式的电镜数据安全实时同步至集群、测试整体存储速度与性能、测试调度软件与环境,测试计算单节点和多节点运行性能、集群各节点系统老化测试、辅助硬件检测与运维、集群管理软件的***时间的升级与定时维护、分布式存储软件的升级与定时维护。

 

应用软件安装与运维:

单颗粒应用软件的安装与维护、单颗粒应用软件的升级、其他电镜应用软件的安装,维护和升级、Relion,cisTEM与EMAN2的培训。

 

电镜平台日常运维:

集群安装部署期间,HPC架构师驻场支持、集群安装部署期间,电镜应用工程师驻场支持、集群服务期间内,配备全职HPC应用工程师远程支持以上所列全部标准服务与协定好的定制服务、集群服务期间内,配备全职电镜应用工程师远程支持以上所列全部标准服务与协定好的定制服务、集群服务期间内,根据用户的需求,电镜应用工程师现场支持以解决远程不能解决的问题。

 

定制服务:

其他需求及服务。

 

样品检查

需求:负染/冷冻样品检查

流程:样品制样、透射电镜经检查

 

从头处理

需求:冷冻数据从头处理

流程:Motion-corection,CTF estimation,Particle picking,2D classification,3D ab-initial,3D classification,3D refinement,High-resolution refinement

 

其他处理需求

需求:提高分辨率、柔性区域处理、局部精修........

流程:Data evalution,Motion-correction,CTF estimation,Particle picking,,2D classification,3D ab-initial,3D classification,3D refinement,High-resolution refinement

 

 

 

 

 

冷冻电镜计算平台

 

 

 

 

作为高性能计算解决方案的提供商,月新对应用场景、平台需求、硬件指标、基建环境等多方面考量,部署出合理的方案。并从硬件采购、上架、网络布置、软件安装与调试以及后期运维一体化服务,加快硬件从落地到使用的速度。提供驻场服务随时解决用户遇到的问题。

 

 

云平台功能

 

 

 

 

 

培训项目:

1、Linux系统使用培训

2、SPA电镜数据处理软件培训

3、电镜电子密度图操作软件

4、电镜电子密度图模型搭建软件

5、自动数据采集软件使用培训

6、Cryo-ET 数据处理软件培训

7、Micro ED数据处理软件培训

 

 

 

 

 

项目一:自动预处理流程软件

 

项目二:自动应用软件安装产品

 

 

 


 

 

 

   

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邮箱:service@proteinnel.com

地址:上海市徐汇区钦州路100号2号楼1201室


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