2018年月新生科冷冻电镜SPA交流分享会顺利举办

作者:Admin 时间: 2019-05-30 浏览量

在生命科学领域，结构生物学已成为理解生命基本原理重要的方法之一。除了常用的X-Ray晶体衍射和核磁共振方法外，低温高压透射电子显微镜成像（简称冷冻电镜）是另一种非常重要的研究与测定大分子复合物三维结构的方法，并具有多种独特的优势。

近年来，随着样品制备方法，成像技术、数据处理算法和I/O密集型高性能计算技术的重大突破，众多复杂的大分子复合物空间分辨率已经可以通过应用冷冻电镜成像方法达到原子级别，并贡献出多项高水平研究成果，吸引越来越多的非电镜领域结构生物学家广泛关注该技术。学习和应用这门新技术的需求正在快速、蓬勃增长。

为了面向非冷冻电镜领域的结构生物学家和尝试进入冷冻电镜领域的研究人员和学生提供快速入门的机会，月新生科尝试通过组织公益性质的技术交流分享会为该技术在国内的广泛应用和推广贡献一份力量。会议主旨侧重于冷冻电镜单颗粒分析（SPA）技术的主流软件的入门与技巧学习，会议形式由讲座和技术讨论会两大部分构成。讲座的主要内容包括：“电镜数据处理的基本原理与主要流程”、“有效分配与调度GPU计算资源”、“Linux基本与重要命令解读”、“RELION3.0全流程与重要参数解读”、“cisTEM全流程与重要参数解读”、“cryoSPACR全流程与重要参数解读”、“UCSF Chimera基本功能与使用技巧”。在讲座每个专题结束后各安排了技术讨论和答疑环节，帮助来宾加深理解、查漏补缺。

10月11、12日，SPA分享交流会上海场在徐汇区钦州路100号上海科委创业中心大礼堂成功举办，有幸邀请到复旦大学医学院陈振国教授作为嘉宾分享了“冷冻电镜单颗粒数据即时处理”的报告，深入浅出地介绍了“on-the-fly data processing“（实时数据处理）的理念和采集数据过程中不同软件的流程模式。

月新生科张翔应用工程师

上海场

12月20、21日，SPA分享交流会北京场在大钟寺东路京仪科技大厦创业园会议中心成功举办。近期，新一届的CASP蛋白质结构预测比赛因为Google Deepmind团队的惊人成绩一举超越所有人类科学家爆冷夺冠，引发全社会广泛热议，我们也有幸邀请了专攻此领域多年的专家王晟博士（阿卜杜拉国王科技大学）分享蛋白质结构预测领域的新研究进展，并分享了他在芝加哥丰田技术研究院（TTIC）与许锦波教授在蛋白质结构预测的工作和取得的重大突破。

阿卜杜拉国王科技大学王晟博士

月新生科张翔应用工程师

现场提问互动

北京场

两场会议吸引到了全国14所高校／科研机构和5家企业的逾300人线上报名和逾20人现场报名，受限于会场规模，我们邀请了240名来宾参与，并收获了150余份关于培训内容满意度的问卷反馈和建议意见。两场会议座无虚席，讲座期间所有来宾全身贯注，讨论期间举手提问此起彼伏，现场讨论气氛热烈，精彩的问答屡次赢得全场热烈掌声致意。

绝大部分来宾对于会议内容、会场布置、茶歇／午餐给予了高度评价和感谢，也留下了中肯的建议。

上海月新生科团队专门运营结构生物学、神经生物学和生物信息学的配套信息技术业务，为国内用户提供HPC、云计算平台的设计/建设/技术服务/软件开发等信息化建设服务，配合用户做实验平台数字化转型。公司成立于2018年2月，团队构建于2015年，目前技术服务团队10余人，其中4名工程师分别负责SPA应用服务、HPC、网络、工程项目管理。

月新生科由北京月新时代全额投资，月新时代成立于2003年，目前有80余人，面向油气勘探业提供大数据HPC和云计算平台产品开发服务，目前技术团队有10余名HPC工程师，研发团队有20余名云计算产品开发人员。

月新时代和月新生科自主研发基于图像/影像类数据分析处理的私有云计算平台产品，底层对接HPC，面向科研用户提供基于浏览器的数据采集、预处理、高性能运算处理、三维可视化的平台软件产品，希望帮助用户解决Drylab数据远程处理流程、远程培训、多人多地协同科研等多种应用需求。

我们正在为国内的结构生物学用户提供冷冻电镜数据分析处理流程的HPC和云计算平台技术咨询和技术服务，我们团队不满足于目前所积累的知识和经验，希望能够紧跟该领域先进的科研团队学习先进理念，掌握新的工具和方法，为国内用户谋求更高效、更专业的技术服务体验。

我们也希望能够贡献绵薄之力，助力国内生命科学研究的蓬勃发展。

2019年月新生科仍会坚持组织这公益性技术交流活动，敬请广大科研工作者和爱好者关注“月新时代”官方微信公众号获取会议信息。